Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN2P32314 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms