Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms