Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB5P28074 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB5P28074 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB5P28074 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB5P28074 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB5P28074 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms