Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK3P27448 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK3P27448 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK3P27448 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK3P27448 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK3P27448 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK3P27448 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK3P27448 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARK3P27448 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARK3P27448 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARK3P27448 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms