Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms