Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITPKAP23677 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITPKAP23677 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms