Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRGP23470 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRGP23470 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
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