Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S100A1P23297 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
S100A1P23297 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms