Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms