Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR4P22455 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms