Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1P21675 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1P21675 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1P21675 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1P21675 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1P21675 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1P21675 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1P21675 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1P21675 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1P21675 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms