Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3BP20337 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms