Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF4P18848 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF4P18848 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF4P18848 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATF4P18848 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms