Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHCEP18577 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHCEP18577 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHCEP18577 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHCEP18577 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHCEP18577 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHCEP18577 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHCEP18577 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms