Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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