Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA1P17302 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA1P17302 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA1P17302 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA1P17302 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA1P17302 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA1P17302 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms