Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF43P17038 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF43P17038 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms