Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL7RP16871 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL7RP16871 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL7RP16871 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL7RP16871 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms