Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSPT1P15170 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSPT1P15170 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms