Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM27P14373 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms