Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCANP13611 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCANP13611 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCANP13611 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCANP13611 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCANP13611 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCANP13611 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms