Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF3P11487 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF3P11487 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF3P11487 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF3P11487 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF3P11487 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF3P11487 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF3P11487 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGF3P11487 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGF3P11487 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGF3P11487 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF3P11487 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGF3P11487 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF3P11487 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF3P11487 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms