Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC192P0DO97 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC192P0DO97 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms