Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGA3P0DJD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms