Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3DP05423 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms