Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-33P01772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms