Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK4O96013 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK4O96013 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK4O96013 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK4O96013 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAK4O96013 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK4O96013 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK4O96013 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK4O96013 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK4O96013 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK4O96013 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK4O96013 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK4O96013 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK4O96013 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK4O96013 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK4O96013 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK4O96013 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK4O96013 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms