Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX7O95931 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX7O95931 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX7O95931 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX7O95931 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX7O95931 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms