Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN13O95857 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN13O95857 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN13O95857 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSPAN13O95857 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN13O95857 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms