Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN15O75808 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN15O75808 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms