Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA10O75578 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms