Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CYFIP2-218ENST00000611925 925 ntTSL 318.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RUFY1-203ENST00000393448 2320 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SIDT2-211ENST00000528397 596 ntTSL 318.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SPINT1-211ENST00000569589 611 ntTSL 318.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC35F2-206ENST00000533664 1007 ntTSL 218.07■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MRVI1-AS1-202ENST00000529829 587 ntTSL 218.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-216ENST00000627449 588 ntTSL 418.02■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZDHHC4-210ENST00000489138 548 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-211ENST00000623253 573 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 517.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DHX30-203ENST00000415400 613 ntTSL 517.93■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 317.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FRS2-202ENST00000547219 611 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATG4C-205ENST00000443289 603 ntTSL 217.88■□□□□ 0.452e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 APBA2-206ENST00000558358 936 ntTSL 317.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMPRSS4-210ENST00000522151 692 ntTSL 317.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC9A3R2-209ENST00000567504 578 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DECR2-210ENST00000465166 702 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CWC15-204ENST00000542907 790 ntTSL 317.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ACAD10-222ENST00000552177 860 ntTSL 317.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.77■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GABBR1-220ENST00000494877 2364 ntTSL 517.77■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-212ENST00000566479 2715 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MICALL1-203ENST00000424008 918 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KANTR-204ENST00000604849 1196 ntTSL 517.72■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 417.64■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF671-202ENST00000594803 460 ntTSL 417.61■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF671-204ENST00000599961 418 ntTSL 417.61■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MST1R-209ENST00000485044 1944 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-217ENST00000557609 1832 ntTSL 517.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM118B-205ENST00000528985 1311 ntTSL 517.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AREL1-203ENST00000473934 535 ntTSL 317.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AREL1-215ENST00000556860 581 ntTSL 317.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DLG3-208ENST00000494493 719 ntTSL 317.55■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX1A-208ENST00000480126 724 ntTSL 517.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 EVL-223ENST00000557384 883 ntTSL 517.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CYFIP2-211ENST00000522637 580 ntTSL 417.5■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-227ENST00000638885 2597 ntTSL 517.49■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKRD23-204ENST00000462692 857 ntTSL 517.47■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-203ENST00000553371 495 ntTSL 417.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-209ENST00000554919 546 ntTSL 417.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-204ENST00000553802 573 ntTSL 317.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-206ENST00000554080 588 ntTSL 417.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-207ENST00000554189 570 ntTSL 417.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-208ENST00000554397 533 ntTSL 417.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-253ENST00000640315 1890 ntTSL 517.41■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-222ENST00000570276 2951 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RAB40C-208ENST00000564703 921 ntTSL 317.32■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF215-204ENST00000529755 1452 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HDAC7-206ENST00000421231 583 ntTSL 417.25■□□□□ 0.352e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HDAC7-207ENST00000422254 593 ntTSL 417.25■□□□□ 0.352e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-220ENST00000569505 564 ntTSL 317.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLEKHA5-204ENST00000510738 2534 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DDX11-209ENST00000536580 838 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX1A-210ENST00000491427 710 ntTSL 217.16■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GNL1-205ENST00000487166 522 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM184B-208ENST00000466117 542 ntTSL 417.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM58A-206ENST00000614851 1006 ntTSL 317.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 172.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 292.3 ms