Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLIN3O60664 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms