Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX16O60231 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX16O60231 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DHX16O60231 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DHX16O60231 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX16O60231 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX16O60231 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX16O60231 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX16O60231 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX16O60231 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX16O60231 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms