Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BUD23O43709 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BUD23O43709 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BUD23O43709 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BUD23O43709 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BUD23O43709 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BUD23O43709 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BUD23O43709 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms