Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms