Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP26A1O43174 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP26A1O43174 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms