Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2DO15399 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms