Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms