Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIEO00221 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms