Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPSO00116 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPSO00116 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms