Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3KR12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
J3KR12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3KR12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3KR12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3KR12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3KR12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3KR12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms