Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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