Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PBE3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PBE3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PBE3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PBE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PBE3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
E9PBE3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms