Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLDN25C9JDP6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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