Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DXG7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DXG7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DXG7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DXG7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DXG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DXG7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DXG7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DXG7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DXG7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
B4DXG7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
B4DXG7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
B4DXG7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DXG7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DXG7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms