Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF487B1APH4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF487B1APH4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms