Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP17L5A8MUK1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L5A8MUK1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L5A8MUK1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms