Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNL1A8MU46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNL1A8MU46 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNL1A8MU46 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNL1A8MU46 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms