Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPOPA6NHQ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPOPA6NHQ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms